Biopsia është një moster indesh që ekzaminohet nën mikroskop. Gjatë një biopsie të drejtuar nga CT Skaneri, pacienti qendron në një skanues CT; pamjet e skanerit ndihmojnë mjekët të përcaktojnë se ku mund të vendosin gjilpërën për të marrë një mostër të indit të dyshimtë.

Organet të cilat janë të zakonshëm per tu kryer biopsia me anë të CT Skanerit janë mëlçia, mushkëritë, veshkat, legeni, pankreasi, pleura, nyjet limfatike, kocka.